Las células de las Algas Pardas están diferenciadas en las siguientes es­tructuras:

13.2.1 PARED CELULAR
Las células de las Algas Pardas tienen una pared celular definida y constituida por una capa interna celulósica y otra externa mucosa compuesta por sustancias características como el ácido algínico y otro polisacárido sulfatado denominado fucoidina. Se ha constatado la presencia de calosa en los tubos cribosos de las Laminariales y en la pared celular de Lamina­ría y Ascophyllum. Algunas especies.de Padina presentan su membrana celular excepcional­mente calcificada y otras especies de las Sphacelariaceae tienen impregnaciones férricas.

13.2.2 CITOPLASMA
Esta restringida a la cara interna de la pared celular, posee muchas vacuolás, generalmente pequeñas, y separadas por bandas citoplasmáticas; otras en cambio, como en Fucus presentan sólo una gran vacuola central. El citoplasma contiene a los cromatóforos, el núcleo y otras inclusiones.

13.2.3 CROMATOFOROS
Los cromatóforos de las Phaeophyta son pocos o numerosos en cada célula; son invariablemente de posición parietal, con excepción de los cromatóforos axiales y estrellados de Bachelotia. Los cromatóforos son generalmente discoidales, acintados, laminares. Estructuralmente presentan lamelas o tilacoides reunidos en grupos de tres y parcialmente interconectadas entre sí. En muchas Algas Pardas se han descrito la presencia de pirenoides, éstos son simples, pedunculados e incluidos en los cromatóforos. En algunos Ordenes no existen cromatóforos. Los pigmentos presentes en los cromatóforos son los mismos indicados anteriormente. De igual modo, además de los productos de reserva señalados, de­bernos destacar la presencia de gran cantidad de vitaminas en diversas Algas Pardas, siendo importante las presentes en las Laminariales de consumo humano como Laminaria que tiene pro-vitamina A y ácido nicotínico.
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13.2.4 NÚCLEO
Las células de las Algas Pardas, generalmente poseen un solo núcleo grande, con uno o más nucléolos; es especialmente visible en la célula apical de las Sphacelariales. La condición multinucleada es rara, aunque se observa en algunas Laminariales y en las células viejas de Halopteris.